Ветеринарная лечебница со слов старейших работников была создана еще до начала Великой Отечественной войны при Машинотракторной станции Куйтунского района. Точную дату образования установить не удалось.
В 1946 году лечебница из Машинотракторной станции Куйтунского района была выделена в самостоятельную организацию — Куйтунская районная ветеринарная лечебница, основателем которой был Сатирко Виктор Михайлович, кадровый офицер из Прибалтики. В 1953 году он был переведен на должность директора Кутуликской сельскохозяйственной школы Куйтунского района. В 1953 году лечебницу возглавил Арановский Василий Николаевич. Спустя год его сменил Тюрьнов Михаил Иванович.
За весь период существования ветеринарной станции сменилось несколько руководителей:
С 1953 г. по 1954 г. - Арановский Василий Николаевич;
С 1954 г. по 1956 г. - Тюрьнов Михаил Иванович;
С 1956 г. по 1959 г. - Павлов Виталий Иванович;
С 1959 г. по 1961 г. - Климов Павел Иннокентьевич;
С 1961 г. по 1964 г. - Дорожков Виктор Михайлович;
С 1964 г. по 1970 г. - Метляев Виктор Иванович;
С 1970 г. по 1981 г. - Иванов Нэлий Кириллович;
С 1981 г. по 1986 г. - Минеева Галина Андреевна;
С 1986 г. по 1987 г. - Делеске Андрей Яковлевич;
С 1987 г. по 2000 г. - Папешин Николай Михайлович;
С 2000 г. по 2011 г. - Зевельтов Степан Васильевич;
С 2011 г. по 2016 г. – Карнаухов Дмитрий Анатольевич.
В 1964 году на основании решения Облисполкома Куйтунская районная ветеринарная лечебница была переименована в Куйтунскую станцию по борьбе с болезнями животных. Руководителем был назначен Метляев Виктор Иванович.
В Куйтунском районе шло бурное развитие животноводства. Только в 70-е годы в районе действовало более 15 хозяйств, которые занимались разведением крупного рогатого скота и птицы. Такое скопление животных повышало вероятность возникновения заразных заболеваний. Поэтому главной и первостепенной задачей для всех специалистов ветстанции было предотвращение случаев заболевания. Хотя эпизоотическая ситуация в районе складывалась непросто. В хозяйствах регистрировали бруцеллез, ящур, туберкулез, чуму свиней, сибирскую язву. На тот период (70-е годы) возглавлял ветстанцию Иванов Нэлий Кириллович. На его плечи легла задача грамотно организовать работу специалистов ветстанции, на которых была возложена большая нагрузка. Ветврачам приходилось выезжать на места не только в рабочее время, но и после. Жители района знали, что могут полагаться на помощь ветврача в любое время суток. Оперативно была организована работа ветлаборатории. На тот период специалистами ветеринарно-бактериологической лаборатории только за один год было поставлено до 150 тысяч проб.
Благодаря мерам по своевременному выявлению заболеваний и изоляции больных животных удалось значительно изменить эпизоотическую обстановку в районе в лучшую сторону. В результате грамотного руководства и сплоченной работы ветеринарных специалистов в районе смогли ликвидировать угрозу распространения данных опасных эпизоотии. Большая заслуга в том таких ветврачей, как: Румянцев Н.А., Румянцева М.Д., Курбетьева Е.Д., Шинкевич Н.А., Ботвинко О.Д., Сизых О.П., Горбасенко Е., Дерягина Р.П.
Немаловажен тот факт, что за годы руководства Нэлия Кирилловича и благодаря его усилиям было построено кирпичное здание, в котором расположился ветеринарный комплекс, состоящий из зданий ветлаборатории, ветлечебницы, вивария, гаража. Введен в эксплуатацию комплекс был в 1981 году. В этом же году на должность руководителя станции пришла трудиться Минеева Галина Андреевна.
В 1986 году станцию возглавил Папешин Николай Михайлович, высокопрофессиональный специалист в области ветеринарии. До этого он работал главным врачом совхоза «Уковский» Нижнеудинского района. Затем работал главным врачом Усольского свинокомплекса. Он проработал руководителем ГУ Куйтунской СББЖ более 14 лет. За эти годы он отдал много сил для улучшения эпизоотического благополучия района по бруцеллезу и лейкозу. Благодаря его деятельности и четкой организации работы по вакцинации и лечению район был оздоровлен от этих заболеваний полностью. Например, в 1999 году под его руководством от лейкоза было вылечено племенное хозяйство колхоза «Годовщина Октября». Всю свою жизнь он посвятил изучению профилактики болезней свиней и был специалистом наивысочайшего класса, специализирующегося по свиноводству. Вместе с ним долгие годы проработал Леонид Алексеевич Кондратистов, который также специализировался по производству свиноводства. Затем он работал главным ветврачом свиноводческих совхозов, а затем курировал свиноводческую отрасль в Управлении сельского хозяйства Иркутской области.
В 1999 году Куйтунскую станцию по борьбе с болезнями животных реорганизовали в Государственное учреждение.
В 2000 году Папешин Николай Михайлович передал руководство станцией Степану Васильевчу Зевельтову.
В 2004 году Государственное учреждение Куйтунская районная станция по борьбе с болезнями животных приобрела статус Областного государственного учреждения на основании Постановления губернатора Иркутской области.
В 2016 году в результате реорганизации Куйтунская станция в качестве филиала была присоединена к ОГБУ "Зиминская СББЖ" с сохранением основных целей деятельности.